| 1976 | Das Buch mit sieben Siegeln | Franz Schmidt; Anton Dermota, Robert Holl, Margarita Kyriaki, Hertha Töpper, Thomas Moser, Artur Korn, Rudolf Scholz, Grazer Concertchor, Niederösterreichisches Tonkünstlerorchester, Alois J. Hochstrasser | | 1 |
| 1983 | Oedipus Rex | Igor Strawinsky; Jessye Norman, Thomas Moser, Alexandru Ionita, Michel Piccoli, Chor und Symphonieorchester des Bayerischen Rundfunks, Colin Davis | | 1 |
| 1985 | Don Giovanni, K. 527 | Mozart; Rafael Kubelík, Symphonieorchester des Bayerischen Rundfunks, Chor des Bayerischen Rundfunks, Alan Titus, Júlia Várady, Arleen Augér, Rolando Panerai, Edith Mathis & Thomas Moser | | 1 |
| 1987 | Die Schöpfung: Arien und Chöre | Joseph Haydn; Judith Blegen, Lucia Popp, Thomas Moser, Kurt Ollmann, Kurt Moll, Chor und Symphonieorchester des Bayerischen Rundfunks, Leonard Bernstein | | 1 |
| 1988 | Requiem | Dvořák; Beňačková, Fassbaender, Moser, Rootering, Czech Philharmonic Chorus and Orchestra, Wolfgang Sawallisch | | 2 |
| 1989 | Mass No. 3 in f minor | Anton Bruckner; Sir Colin Davis, Symphonieorchester des Bayerischen Rundfunks, Chor des Bayerischen Rundfunks, Kurt Moll, Karita Mattila, Thomas Moser, Marjana Lipovšek | | 1 |
| 1991 | Der ferne Klang | Franz Schreker; Thomas Moser, Gabriele Schnaut, Victor von Halem, Siegmund Nimsgern, Hans Helm, Roland Hermann, Radio-Symphonie-Orchester Berlin, Gerd Albrecht | | 1 |
| 1991 | Jessonda | Louis Spohr; Várady, Behle, Moser, Moll, Fischer‐Dieskau, Gerd Albrecht | | 1 |
| 1995 | La Damnation de Faust | Berlioz; Susan Graham, Thomas Moser, José van Dam, Orchestre et Chœur de l’Opéra de Lyon, Kent Nagano | | 1 |
| 2002 | Gurrelieder | Schoenberg; Karita Mattila, Anne Sofie von Otter, Thomas Moser, Philip Langridge, Thomas Quasthoff, Rundfunkchor Berlin, MDR Rundfunkchor, Ernst Senff Chor, Berliner Philharmoniker, Simon Rattle | | 1 |
| 2002 | Roméo & Juliette | Berlioz; Olga Borodina, Thomas Moser, Alastair Miles, Chor des Bayerischen Rundfunks, Wiener Philharmoniker, London Symphony Orchestra, Sir Colin Davis | | 1 |
| 2005 | Königskinder / The King’s Children | Engelbert Humperdinck; Dagmar Schellenberger, Thomas Moser, Dietrich Henschel, Marilyn Schmiege, Chor des Bayerischen Rundfunks, Münchner Rundfunkorchester, Fabio Luisi | | 1 |
| 2010 | Das Lied von der Erde: composer's piano version | Mahler; Brigitte Fassbaender, Thomas Moser, Cyprien Katsaris | 5 | 1 |
| 2011 | Roméo et Juliette | Berlioz; Olga Borodina, Thomas Moser, Alastair Miles, Chor des Bayerischen Rundfunks, Wiener Philharmoniker, Sir Colin Davis | | 2 |
| 2020 | Missa solemnis, Op. 123 | Beethoven; Alison Hargan, Marjana Lipovšek, Thomas Moser, Matthias Hölle, Wiener Singverein, ORF Vienna Radio Symphony Orchestra, Michael Gielen | | 1 |
